当事人规定还款协议中的违约金是合法的。但违约金的数额不能约定的过高或过低。如果约定的违约金的数额和实际损失相比，过高或过低的，另一方当事人可以请求仲裁机构或法院予以适当减少或增加。根据2021年实施的《民法典》第五百八十五条规定，当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
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首先要看合同中是否有约定违约金，如果有一般就按照合同违约责任计算来进行赔偿。如果没有约定，则按照违约一方给对方造成的损失来进行赔偿。
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根据《中华人民共和国合同法》的相关规定，当合同违约了之后，赔偿金额应这样计算：一、当事人在合同中明确约定违约金的数额或者计算方法，并且约定不违法，也无明显不合理的，则适用合同约定的违约金。但如果合同约定的违约金数额低于造成的损失的，当事人可以请求法院或者仲裁机构予以增加；如果约定违约金过分高于造成的损失，当事人可以请求法院或者仲裁机构予以适当减少。二、法律法规对某一类合同的违约金有明确规定，并且不允许当事人自由约定的，无论当事人是否约定了违约金，都应适用法定违约金。三、法律法规对某一类合同的违约金作了规定，但同时允许当事人自由约定违约金，如果当事人已经约定了违约金，则适用当事人的约定；如果当事人没有约定违约金，则适用法定违约金。